5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine(Synonyms: 2′-脱氧-5-(羟甲基)胞啶; 5hmdC)

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5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine (Synonyms: 2′-脱氧-5-(羟甲基)胞啶; 5hmdC)

5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine (5hmdC) 是 DNA 中 5-methyl-2′-deoxycytidine (5-mdC) 的氧化衍生物。5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine 可能作为细胞不可逆转损伤的标志物。

5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine(Synonyms: 2

5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine Chemical Structure

CAS No. : 7226-77-9

规格 价格 是否有货 数量
5 mg ¥1000 In-stock
10 mg ¥1500 In-stock
50 mg ¥4100 In-stock
100 mg ¥6200 In-stock
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生物活性

5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine (5hmdC) is an oxidation derivative of 5-methyl-2′-deoxycytidine (5-mdC) in DNA. 5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine may serve as a marker of irreversibly damaged cells[1][2].

分子量

257.24

Formula

C10H15N3O5

CAS 号

7226-77-9

中文名称

2′-脱氧-5-(羟甲基)胞啶

运输条件

Room temperature in continental US; may vary elsewhere.

储存方式
Powder -20°C 3 years
4°C 2 years
In solvent -80°C 6 months
-20°C 1 month
溶解性数据
In Vitro: 

DMSO : 50 mg/mL (194.37 mM; Need ultrasonic)

配制储备液
浓度 溶剂体积 质量 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.8874 mL 19.4371 mL 38.8742 mL
5 mM 0.7775 mL 3.8874 mL 7.7748 mL
10 mM 0.3887 mL 1.9437 mL 3.8874 mL

*

请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液;一旦配成溶液,请分装保存,避免反复冻融造成的产品失效
储备液的保存方式和期限:-80°C, 6 months; -20°C, 1 month。-80°C 储存时,请在 6 个月内使用,-20°C 储存时,请在 1 个月内使用。

In Vivo:

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解方案。以下溶解方案都请先按照 In Vitro 方式配制澄清的储备液,再依次添加助溶剂:

——为保证实验结果的可靠性,澄清的储备液可以根据储存条件,适当保存;体内实验的工作液,建议您现用现配,当天使用; 以下溶剂前显示的百
分比是指该溶剂在您配制终溶液中的体积占比;如在配制过程中出现沉淀、析出现象,可以通过加热和/或超声的方式助溶

  • 1.

    请依序添加每种溶剂: 10% DMSO    40% PEG300    5% Tween-80    45% saline

    Solubility: ≥ 2.5 mg/mL (9.72 mM); Clear solution

    此方案可获得 ≥ 2.5 mg/mL (9.72 mM,饱和度未知) 的澄清溶液。

    以 1 mL 工作液为例,取 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀;然后继续加入 450 μL生理盐水定容至 1 mL。

    将 0.9 g 氯化钠,完全溶解于 100 mL ddH₂O 中,得到澄清透明的生理盐水溶液

  • 2.

    请依序添加每种溶剂: 10% DMSO    90% (20% SBE-β-CD in saline)

    Solubility: ≥ 2.5 mg/mL (9.72 mM); Clear solution

    此方案可获得 ≥ 2.5 mg/mL (9.72 mM,饱和度未知) 的澄清溶液。

    以 1 mL 工作液为例,取 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL 20% 的 SBE-β-CD 生理盐水水溶液中,混合均匀。

    将 2 g 磺丁基醚 β-环糊精加入 5 mL 生理盐水中,再用生理盐水定容至 10 mL,完全溶解,澄清透明
  • 3.

    请依序添加每种溶剂: 10% DMSO    90% corn oil

    Solubility: ≥ 2.5 mg/mL (9.72 mM); Clear solution

    此方案可获得 ≥ 2.5 mg/mL (9.72 mM,饱和度未知) 的澄清溶液,此方案不适用于实验周期在半个月以上的实验。

    以 1 mL 工作液为例,取 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL玉米油中,混合均匀。

*以上所有助溶剂都可在 Shanghai Jinpan Biotech Co Ltd 网站选购。
参考文献
  • [1]. Ewelina Zarakowska, et al. Oxidation Products of 5-Methylcytosine are Decreased in Senescent Cells and Tissues of Progeroid Mice. J Gerontol A Biol Sci Med Sci. 2018 Jul 9;73(8):1003-1009.

    [2]. Shuo Liu, et al. Quantitative assessment of Tet-induced oxidation products of 5-methylcytosine in cellular and tissue DNA. Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(13):6421-9.

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